新鮮膽汁之所以是黃褐色的，而有時候在吐墨綠色膽汁或有墨綠色大便，主要與膽色素的氧化反應以及腸道消化過程有關。
1. 剛分泌的膽汁為什麼是黃褐色的？ 膽汁的顏色主要由兩種膽色素決定：呈現黃褐色（或橙黃色）的「膽紅素」（Bilirubin），以及其氧化型態、呈現綠色的「膽綠素」（Biliverdin）。在人體中，由肝臟分泌並經由壺腹排入十二指腸的新鮮膽汁，其膽紅素的濃度遠高於膽綠素，因此視覺上會呈現明亮的黃褐色或金黃色。
2. 為什麼做胃鏡時會看到墨綠色的膽汁？ 這是因為發生了氧化反應。當患者有幽門功能不全等狀況，導致膽汁逆流並滯留在胃裡時，原本黃褐色的膽紅素暴露在空氣中或在消化道內停留，非常容易被氧化成綠色的膽綠素。因此，在胃部停留過一段時間的膽汁，就會因為氧化而變成明顯的草綠色或墨綠色。
3. 為什麼會出現墨綠色的大便？ 墨綠色大便的形成，通常與以下三個主要因素有關：
- 腸胃蠕動過快（膽汁來不及分解）： 在正常的消化過程中，膽汁進入大腸後會被腸道細菌還原成尿膽素原，最終轉化為糞膽素（Stercobilin），使大便呈現正常的黃褐色。如果發生腹瀉、腸胃炎或消化不良導致腸胃蠕動過快，膽汁在結腸停留的時間太短，細菌沒有足夠的時間將其徹底代謝；同時，腸道中的微量氧氣與細菌反而在這過程中將膽紅素氧化成了膽綠素，就會導致排出的糞便呈現綠色或墨綠色。
- 飲食因素（最常見）： 攝取大量富含葉綠素的深綠色蔬菜（如菠菜、地瓜葉、空心菜），或是含有綠色/藍色天然及人工色素的食物（如抹茶、螺旋藻），都會讓大便變成墨綠色。
- 藥物與營養補充品： 服用鐵劑是非常經典的原因，因為腸道無法完全吸收的鐵質在與空氣或腸道細菌作用後，會使大便呈現深綠色、墨綠色甚至偏黑色。此外，含有高劑量鐵質或葉酸的綜合維他命，或是某些會改變腸道菌叢的抗生素，也可能改變糞便的顏色。